Wissenschaftliche Mitarbeitende / Postdoktorandin / Postdoktorand (d / w / m) bioinformatisch in der translationalen Tumorforschung - DM.18.24a : Charité

Wissenschaftliche Mitarbeitende / Postdoktorandin / Postdoktorand (d / w / m) bioinformatisch in der translationalen Tumorforschung - DM.18.24a : Charité

Arbeiten an der Charité

Die Max-Eder Forschungsgruppe von Dr. med. Livius Penter sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt nach einer hoch motivierten bioinformatischen Postdoktorandin / einem hoch motivierten bioinformatischen Postdoktoranden auf dem Gebiet der translationalen Tumorimmunologie mit Fokus Hämatologie und Stammzelltransplantation.

Das Ziel der Forschungsgruppe ist es mit modernen Sequenziermethoden an primären human Proben ein besseres Verständnis zu erlangen, wie Tumor- und Immunzellen interagieren und Immunantworten gezielt therapeutisch moduliert werden können, um langfristige Krankheitskontrolle zu erlangen. Wir nutzen hierfür eine detaillierte bioinformatische Auswertung von selbst generierten und öffentlich zugänglichen immunogenetischen bulk, single cell und spatial Datensätzen.

Die Stelle im Überblick

• Planung und Supervision von Einzelzell-, spatial und Bulksequenzierexperimenten in Zusammenarbeit mit Mitarbeitern der Gruppe
• Auswertung von Einzelzelldatensätzen (single cell RNA / DNA / TCR / ATAC sequencing)
• Auswertung von räumlichen (spatial) Datensätzen
• Auswertung von immunogenetischen Datensätzen (z.B. T-Zell- und B-Zellrezeptorsequenzierung; whole-exome sequencing, etc.)
• Entwicklung neuer Sequenziermethoden und Auswertungspipelines
• Verwaltung und Prozessierung von Rohdatensätzen auf Clusterinfrastruktur
• Planung und Supervision von Validierungsexperimenten in Zusammenarbeit mit Mitarbeitern der Gruppe (z.B Kokulturexperimente von T-Zellen und Tumorzellen; Reexpression von TCRs; etc.)

Das Projekt wird eingebettet in die Arbeit der Max-Eder Forschungsgruppe von Livius Penter, die sich zum Ziel gesetzt hat, tumorimmunologische Fragestellungen im Bereich der Hämatologie mit Hilfe von modernen immunogenetischen Datenanalysemethoden zu bearbeiten. Der Fokus der Arbeit wird auf bioinformatische Auswertungen mit spezialisierten Analysemethoden liegen.

Neben eigener Projektarbeit wird die Supervision von PhD-, Master und Medizinstudenten im Fokus stehen.

Wir streben an, in einem internationalen und kooperativen Umfeld in Zusammenarbeit mit weiteren Partnern im Raum Berlin, wie zum Beispiel dem Berlin Institute of Health (BIH) oder dem Berlin Institute for Medical System's Biology (BIMSB), relevante Projekte zu bearbeiten, die einen hohen Impact haben. Hierbei steht auch die individuelle Karrierentwicklung aller Mitarbeiter mit im Vordergrund (z.B. aktive Kongressteilnahme, Publikationen, Einwerbung eigener Drittmittel).

Wissenschaftlichen Mitarbeitenden wird nach Maßgabe Ihres Dienstverhältnisses ausreichend Zeit zu eigener wiss. Arbeit gegeben.

Danach suchen wir

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