Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in (Postdoc) (m/w/d) für „Intercellular communication of immune and stromal cells in the organ context“

Details zu diesem Stellenangebot

Jobtitel Wissenschaftliche / r Mitarbeiter / in (Postdoc) (m / w / d) für Intercellular communication of immune and stromal cells in the organ context Einsatzbereich Institut für Experimentelle Immunologie und Bildgebung - Abteilung für Immundynamik Stellenart Wissenschaftliche Stelle Stellen-ID 11174 Eintritt nächstmöglicher Zeitpunkt Umfang Vollzeit;

38,5 Std. Vertragsart Befristet Befristung 36 Monate ab Beginn der Beschäftigung; Projektbefristung gem. 14 Abs. 1 TzBfG Vergütung EG 13 TV-L Bewerbung Online Bewerbung - Gleich hier mit nur wenigen Klicks :

Ihre Aufgaben

Probenvorbereitung und Messung

• Komplexe Probenaufarbeitung und Messung im Labor unter S1 und S2 Bedingungen
• Kollaborative Anwendung von präklinischen in vivo und in vitro Modellen für multimodales Imaging und Massenspektrometrie
• Isolation von Gewebe und Zellen durch Lasermikrodissektion für weiterführende massenspektrometrische Untersuchungen
• Etablierung und Messung von multiplex Immunfluoreszenz-Mikroskopie Färbungen und Vorbereitung der histologischen Schnitte für die Massenspektrometrie

Erarbeitung und Auswertung multimodaler Datensätze

• Etablierung bioinformatischer Algorithmen zur Co-Registrierung von multi-omics Ansätzen aus massenspektrometrischen- und mikroskopischen Datensätzen
• Integrative Beurteilung der Daten mittels Multivariate Analysen, Dimensionalitätsreduktion und Pathway , Signaling und Enrichment Analysen
• Erarbeitung mathematischer und statistischer Algorithmen zur funktionellen Auswertung von multimodalen Imaging Datensätzen sowie Entwicklung neuer bio-informatischer Analyse-Verfahren auf Grundlage multimodaler Datensätze

Etablierung und Analyse von massenspektrometrischen und mikroskopischen Datensätzen

• Automatisierte Analyse massenspektrometrischer und mikroskopischer Datensätze mittels Segmentierungsalgorithmen und KI
• Etablierung neuer Algorithmen des maschinellen Lernens, um Muster in massenspektrometrischen und mikroskopischen Datensätzen zu identifizieren und Integration der Forschung in die Verbundprojekte
• Entwicklung von Methoden zur "minimalen proteomischen Probenvorbereitung" für die LC-MS / MS

Einbindung in neuartige "cutting edge" Technologien und Ausbildung von Studierenden

• Unterstützung der Arbeitsgruppe Single-cell and spatial multi-omics
• Betreuung von Bachelor-, Master- und PhD Studierenden

Ihr Profil

• Abgeschlossene Promotion in Chemie, Physik, Molekularbiologie, Biomedizin, Biologie oder vergleichbaren Studiengängen
• Sie arbeiten selbständig, eigenverantwortlich und zuverlässig
• Sie sind flexibel, engagiert und zuverlässig
• Sie besitzen sehr gute EDV- und Englischkenntnisse

Wünschenswerte Kenntnisse und Kenntnisse, die im Rahmen der Arbeit ausgebaut werden sollen

• Erste Erfahrungen in der Massenspektrometrie, Bioinformatik, Mikroskopie, Systembiologie und Immunologie
• Erste Erfahrungen in der Analyse mikroskopischer und massenspektrometrischer Datensätze sowie Integrative Analysen über Systembiologie und KI-Algorithmen des maschinellen Lernens
• Erste Erfahrungen in den Softwares / Sprachen / Anwendungen, wie z.B. MS-Office, Spectronaut, DIA-NN, Proteome Discoverer, R, Python, Cytoscape, ScilsLab, String, GSEA

Freuen Sie sich auf

• Einen sicheren Arbeitsplatz im öffentlichen Dienst des Landes NRW
• Faire Bezahlung nach Tarif (TV-L) inkl. Jahressonderzahlung und betrieblicher Zusatzversorgung
• 30 Tage Urlaub im Kalenderjahr (bei einer 5-Tage-Woche)
• Interdisziplinäres Arbeiten mit Kolleginnen und Kollegen aus anderen Fachbereichen
• Arbeiten mit moderner Ausstattung und zertifizierten Qualitätsstandards
• Familienfreundliche Unternehmenskult u r , z. B. Betriebskindertagesstätte, Ferienprogramm für schulpflichtige Kinder, Beratung und Unterstützung durch das MitarbeiterServiceBüro in allen Lebenslagen
• Vielfältige Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten , bspw. in der Bildungsakademie des UK Essen
• Gesundheitsmanagement , z. B. Betriebliches Eingliederungsmanagement, Impfungen, Förderung von Sportangeboten
• Attraktive Zusatzleistungen , bspw. vergünstigtes Kantinenessen, Gemeinschaftsevents, Wohnheimplätze

Rahmenbedingungen

• Das UK Essen strebt eine Erhöhung des Frauenanteils in Bereichen an, in denen Frauen unterrepräsentiert sind. Sie werden zur Bewerbung aufgefordert und im Sinne des LGGs bei gleicher Qualifikation vorrangig berücksichtigt.
• Schwerbehinderte Bewerberinnen / Bewerber und Gleichgestellte i.S. des 2 Abs. 3 SGB IX werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt.
• Die ausgeschriebene Stelle ist grundsätzlich auch für Teilzeitbeschäftigte geeignet.
• Die Eingruppierung richtet sich nach den persönlichen und tariflichen Voraussetzungen.
• Eine Bescheinigung gemäß 23a Infektionsschutzgesetz (IfSG) über den Impf- und Serostatus bzgl. Masern ist erforderlich.

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