Bioinformatiker - Datenanalyse, Python, Java (m/w/d)

Die Abteilung der Experimentellen Chirurgie am Institut INSURE - Institute for Translational Cardiac Surgery der Klinik für Herz- und Gefäßchirurgie sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen

Bioinformatiker (m / w / d)

In der Abteilung für Experimentelle Chirurgie werden Grundlagenwissenschaften im Bereich der kardialen Entwicklungsbiologie, der kardialen Regeneration und der molekularen Kartierung mit präklinischer Forschung kombiniert.

Ihre Verantwortlichkeit liegt in der Einrichtung und dem Betrieb von Rechenpipelines zur Vorbereitung und Integration von Datensätzen aus Hochdurchsatz-Experimenten und der Durchführung von Datenanalysen.

Weiterhin sind Sie für die Betreuung der Server-Infrastruktur, sowie der Softwareumgebung verantwortlich.

Ihre Aufgaben

• Einrichtung und Benchmarking von Pipelines für die Vorverarbeitung und Analysen von DNA-Datensätzen (GWAS, WES, WGS), RNAseq, single-cell RNAseq, Proteomik- und Metabolomik-Datensätzen
• Unterstützung des Dateninformationssystems (DIS) der kardiovaskulären Biobank (KaBi-DHM)
• Betreuung des Forschungsdatenmanagements

Ihr Profil

• Erfolgreich abgeschlossenes Hochschulstudium (Master, Diplom Univ. ) in Bioinformatik, Informatik, Biologie oder einem verwandten Fachgebiet
• Promotion in diesem Bereich ist von Vorteil
• Erfahrung in der Vorverarbeitung und Analyse von Hochdurchsatzdaten
• Erfahrung in R, Python, Java und anderen gängigen Programmiersprachen
• Erfahrung mit UNIX / Linux
• Erfahrung mit Versionskontrollen
• Erfahrung mit Workflow-Management-Systemen
• Erfahrung mit Hochdurchsatz-Rechnersystemen
• Erfahrung mit Datenbanken und Laborinformationssystemen
• Ausgezeichnete schriftliche und mündliche Kommunikation in Englisch

Sie haben bereits in vergleichbarer Position Projekte bearbeitet und zeichnen sich durch Verantwortungsbewusstsein, Engagement, Belastbarkeit sowie gute Kommunikations- und Integrationsfähigkeit aus.

Ein professionelles Auftreten, gute Kommunikationsfähigkeiten und ausgeprägte Teamfähigkeit sind für uns selbstverständlich.

Unser Angebot

• Eine sehr interessante berufliche Herausforderung in einem universitär und international geprägten Umfeld
• Ein zunächst auf ein Jahr befristeter Arbeitsvertrag mit langfristigen Perspektiven
• Vergütung nach dem TV-L (inkl. Jahressonderzahlung)
• Fort- und Weiterbildungsangebote
• Betriebliche Altersvorsorge / Betriebsrente
• Personalrestaurant
• Mit unserem Firmen-Fitnesspartner EGYM Wellpass unbegrenzt in über 8.000 Sport- und Gesundheitseinrichtungen deutschlandweit trainieren
• Zahlreiche Rabattmöglichkeiten für unsere Mitarbeitenden über das Vorteilsprogramm corporate benefits, Fahrrad-Leasing mit JobBike Bayern und andere Vergünstigungen

Das Deutsche Herzzentrum München fördert aktiv die Gleichstellung aller Mitarbeiter und Mitarbeiterinnen. Wir begrüßen deshalb Bewerbungen von Männern und Frauen, unabhängig von deren kultureller und sozialer Herkunft, Alter, Religion, Weltanschauung, Behinderung oder persönlicher Identität.

Bewerber und Bewerberinnen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung unter Berücksichtigung aller Umstände des Einzelfalls bevorzugt.