Machine learning scientist Jobs in Essen

Microscopy Scientist (m/f/x) / Mikroskopie-Wissenschaftler (m/w/d) Forschung und Lehre

• Einsatzort: Bochum
• Umfang: Vollzeit
• Beginn: zum nächstmöglichen Zeitpunkt
• Befristung: Unbefristet

BG Klinik und Universitätsklinikum der Ruhr-Universität Bochum – diese in Deutschland einmalige Kombination macht das Bergmannsheil zu einer der ersten Adressen für bestmögliche medizinische Versorgung. Es ist insbesondere spezialisiert auf die Akutversorgung und Rehabilitation schwerverletzter und berufserkrankter Menschen. Für die Menschen geben mehr als 2.500 Beschäftigte und unsere 23 Kliniken und Fachabteilungen täglich alles – und begleiten sie interdisziplinär während des gesamten Behandlungsverlaufs. Auch im BG Universitätsklinikum Bergmannsheil Bochum ist das ein harter Job. Doch bei uns gibt es dafür alles, was es braucht, um alles zu geben.

Chancengleichheit, eine respektvolle Zusammenarbeit und selbstbestimmte Teilhabe von Menschen mit Schwerbehinderung und ihnen Gleichgestellten sind innerhalb der BG Kliniken selbstverständlich. Deshalb werden schwerbehinderte Bewerber (m/w/d) bei gleicher Eignung bei uns bevorzugt berücksichtigt.
Weitere Informationen finden Sie hier:

https://www.bg-kliniken.de/ueber-uns/das-unternehmen/inklusion/

About THINK/ Über THINK

(EN)
The newly established Center for Theoretical and Integrative Neuro- and Cognitive Science (THINK) at Ruhr-University Bochum will commence operations in 2026 and offers a highly interdisciplinary and international research environment dedicated to advancing a mechanistic understanding of cognition across species and levels of analysis. THINK combines human and animal research with cutting-edge infrastructure, including advanced microscopy, MRI, EEG, virtual reality, neurophysiology, optogenetics, molecular biology, and high-performance computing facilities.
We are seeking a full-time Microscopy Scientist with expertise in advanced light microscopy to support and further develop THINK’s shared imaging infrastructure and collaborative imaging-based research projects.
Employment will be through the Department of Neurology at the BG Universitätsklinikum Bergmannsheil as part of the University Hospital of Ruhr-University Bochum.
Further information:

www.rub.de/think

(DEU)
Das neu gegründete Center for Theoretical and Integrative Neuro- and Cognitive Science (THINK) an der Ruhr-Universität Bochum wird 2026 seinen Betrieb aufnehmen und bietet ein hochinterdisziplinäres sowie internationales Forschungsumfeld zur Erforschung neuronaler und kognitiver Mechanismen über verschiedene Spezies und Analyseebenen hinweg. THINK vereint Human- und Tierforschung mit modernster Forschungsinfrastruktur, darunter fortgeschrittene Mikroskopie, MRT, EEG, Virtual Reality, Neurophysiologie, Optogenetik, Molekularbiologie und Hochleistungsrechnen.
Gesucht wird ein/e Mikroskopie-Wissenschaftler/in in Vollzeit mit Expertise in moderner Lichtmikroskopie zur Unterstützung und Weiterentwicklung der gemeinsamen Imaging-Infrastruktur sowie kollaborativer bildgebungsbasierter Forschungsprojekte.
Die Anstellung erfolgt über die Klinik für Neurologie des BG Universitätsklinikums Bergmannsheil Bochum als Teil des Universitätsklinikums der Ruhr-Universität Bochum.
Weitere Informationen:

www.rub.de/think

English version

Your tasks

• Develop, optimize, and support advanced light microscopy techniques, including confocal, automated and conventional fluorescence, multiphoton, and live-cell imaging under physiological conditions
• Establish and maintain workflows for automated image acquisition and quantitative analysis, including segmentation and machine-learning–assisted image processing
• Train and support THINK research groups in the independent operation of microscopes, experimental setup, and data analysis
• Monitor and ensure quality control and calibration of all microscopy systems
• Maintain and update microscopy-related hardware, software, and analysis pipelines
• Liaise with instrument manufacturers for troubleshooting, maintenance, and upgrades
• Ensure compliance with institutional and international microscopy and biosafety standards
• Manage and organize data acquisition using standardized formats and facilitate access to computing resources for image analysis
• Foster integration with other imaging modalities (MRI, electrophysiology, behavioral labs) within THINK’s research infrastructure

Your Profile

• PhD in Neuroscience, Biology, Biophysics, Biomedical Engineering, or a related field with strong expertise in light microscopy
• Proven ability to design, implement, and optimize microscopy-based experiments using confocal and other advanced light-microscopy methods
• Strong background in light microscopy; familiarity with or willingness to develop expertise in multiphoton and live-cell imaging
• Demonstrated experience in quantitative image analysis and data management, ideally including automated or machine-learning–based segmentation approaches
• Documented track record of scientific publications, including first- and/or senior-author papers in peer-reviewed journals
• Experience in microscope calibration, maintenance, and quality control
• Strong understanding of cellular and neuroanatomical imaging approaches
• Excellent analytical and organizational skills; ability to work independently and collaboratively in an interdisciplinary environment
• Willingness to work in a collaborative and support position for multiple groups across THINK
• Fluent English (C1 level or higher); German knowledge is advantageous but not required
• Familiarity with open-science principles and data-sharing standards is a plus

We offer

• Very dynamic and active research environment
• Challenging and versatile tasks
• Team-oriented collaboration in a committed, international and appreciative team
• Extensive training and further education opportunities
• Flexible working hours and family-friendly working conditions
• Payment and other social benefits in accordance with TV
• 30 days paid vacation/year
• Paid time off on Christmas Eve and New Year's Eve
• Company pension scheme
• Employment at one of the largest universities in Germany within the University Alliance Ruhr
• A varied sports program with around 100 sport disciplines and the university's own gym
• Discounts for bike rental systems and bike purchases

Deutsche Version

Ihre Aufgaben

• Entwicklung, Optimierung und Unterstützung moderner lichtmikroskopischer Verfahren, einschließlich konfokaler, automatisierter und konventioneller Fluoreszenzmikroskopie, Multiphotonen- sowie Live-Cell-Imaging unter physiologischen Bedingungen
• Etablierung und Pflege von Workflows für automatisierte Bildaufnahme und quantitative Bildanalyse, einschließlich Segmentierung und KI-/Machine-Learning-gestützter Bildverarbeitung
• Schulung und Unterstützung der THINK-Arbeitsgruppen bei der eigenständigen Nutzung der Mikroskope, beim experimentellen Aufbau sowie bei der Datenanalyse
• Überwachung und Sicherstellung der Qualitätskontrolle und Kalibrierung aller Mikroskopiesysteme
• Wartung und Aktualisierung mikroskopiebezogener Hard- und Software sowie Analysepipelines
• Zusammenarbeit mit Geräteherstellern bei Fehlerbehebung, Wartung und System-Upgrades
• Sicherstellung der Einhaltung institutioneller und internationaler Standards für Mikroskopie und Biosicherheit
• Organisation und Verwaltung der Datenerfassung unter Verwendung standardisierter Formate sowie Unterstützung beim Zugang zu Rechenressourcen für Bildanalysen
• Förderung der Integration mit anderen Bildgebungsmodalitäten (MRT, Elektrophysiologie, Verhaltenslabore) innerhalb der THINK-Infrastruktur

Ihr Profil

• Promotion in Neurowissenschaften, Biologie, Biophysik, Biomedizintechnik oder einem verwandten Fachgebiet mit ausgewiesener Expertise in der Lichtmikroskopie
• Nachgewiesene Fähigkeit zur Planung, Durchführung und Optimierung mikroskopiebasierter Experimente unter Einsatz konfokaler und anderer moderner lichtmikroskopischer Verfahren
• Fundierter Hintergrund in der Lichtmikroskopie; Erfahrung oder Bereitschaft zur Vertiefung in Multiphotonen- und Live-Cell-Imaging
• Erfahrung in quantitativer Bildanalyse und Datenmanagement, idealerweise einschließlich automatisierter oder Machine-Learning-basierter Segmentierungsansätze
• Dokumentierte wissenschaftliche Publikationen, einschließlich Erst- und/oder Senior-Autorenschaften in peer-reviewten Fachzeitschriften
• Erfahrung in Kalibrierung, Wartung und Qualitätskontrolle von Mikroskopen
• Fundiertes Verständnis zellulärer und neuroanatomischer Bildgebungsverfahren
• Ausgeprägte analytische und organisatorische Fähigkeiten sowie die Fähigkeit, selbstständig und interdisziplinär zu arbeiten
• Bereitschaft, in einer unterstützenden und kollaborativen Funktion für mehrere Gruppen innerhalb von THINK tätig zu sein
• Sehr gute Englischkenntnisse (mindestens Niveau C1); Deutschkenntnisse sind von Vorteil, aber keine Voraussetzung
• Kenntnisse zu Open-Science-Prinzipien und Datenstandards sind wünschenswert

Wir bieten

• Ein sehr dynamisches und aktives Forschungsumfeld
• Anspruchsvolle und vielseitige Aufgaben
• Teamorientierte Zusammenarbeit in einem engagierten, internationalen und wertschätzenden Team
• Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
• Flexible Arbeitszeiten und familienfreundliche Arbeitsbedingungen
• Vergütung und Sozialleistungen Tarifvertrag
• 30 Tage Urlaub pro Jahr
• Zusätzliche freie Tage an Heiligabend und Silvester
• Betriebliche Altersvorsorge
• Beschäftigung an einer der größten Universitäten Deutschlands innerhalb der University Alliance Ruhr
• Ein vielfältiges Hochschulsportangebot mit rund 100 Sportarten und universitätseigenem Fitnessstudio
• Vergünstigungen für Fahrrad-Leasing und Fahrradkauf

More Informations/ Weitere Informationen

We look forward to receiving your application by June 30,2026, including your earliest possible start date.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung bis zum 30.06.2026 unter Angabe Ihres frühestmöglichen Eintrittstermins.

Kontakt

Prof. Dr. Tobias Rock
Neurologische Universitätsklinik und Poliklinik